Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem253Q3UNB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem253Q3UNB8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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