Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Washc4Q3UMB9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Washc4Q3UMB9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 514.3 ms