Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3UJP5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3UJP5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UJP5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3UJP5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3UJP5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UJP5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3UJP5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Q3UJP5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms