Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpr55Q3UJF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms