Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnep1r1Q3UJ81 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms