Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc34Q3UI66 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms