Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph3aQ3UFY4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms