Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnft2Q3UF64 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms