Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Yipf3Q3UDR8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Yipf3Q3UDR8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms