Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3U595 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U595 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U595 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U595 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U595 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U595 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3U595 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U595 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U595 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U595 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U595 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U595 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U595 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U595 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U595 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U595 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U595 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U595 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms