Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hectd3Q3U487 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hectd3Q3U487 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms