Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hvcn1Q3U2S8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hvcn1Q3U2S8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms