Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms