Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kdm4dQ3U2K5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kdm4dQ3U2K5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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