Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim6Q3U0I6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms