Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Calr4Q3TQS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Calr4Q3TQS0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms