Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pde12Q3TIU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pde12Q3TIU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms