Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2afvQ3THW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2afvQ3THW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms