Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms