Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Prex2Q3LAC4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Prex2Q3LAC4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prex2Q3LAC4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms