Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm1Q2TV84 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm1Q2TV84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpm1Q2TV84 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpm1Q2TV84 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms