Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cpne9Q1RLL3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne9Q1RLL3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne9Q1RLL3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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