Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rpusd3Q14AI6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Rpusd3Q14AI6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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Rpusd3Q14AI6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Rpusd3Q14AI6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rpusd3Q14AI6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpusd3Q14AI6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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