Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Perm1Q149B8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Perm1Q149B8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Perm1Q149B8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms