Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samd12Q0VE29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samd12Q0VE29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms