Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itgb8Q0VBD0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb8Q0VBD0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms