Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SobpQ0P5V2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SobpQ0P5V2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SobpQ0P5V2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SobpQ0P5V2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms