Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmbpQ07456 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms