Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrstQ06666 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrstQ06666 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms