Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcad1Q04692 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcad1Q04692 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcad1Q04692 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms