Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RelaQ04207 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RelaQ04207 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RelaQ04207 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RelaQ04207 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RelaQ04207 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RelaQ04207 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RelaQ04207 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RelaQ04207 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RelaQ04207 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RelaQ04207 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RelaQ04207 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms