Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr1Q03146 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms