Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp1Q01514 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp1Q01514 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms