Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SelpQ01102 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelpQ01102 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SelpQ01102 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SelpQ01102 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelpQ01102 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SelpQ01102 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms