Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin2cQ01098 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin2cQ01098 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin2cQ01098 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms