Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Grin2bQ01097 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Grin2bQ01097 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Grin2bQ01097 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Grin2bQ01097 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2bQ01097 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms