Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde1bQ01065 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde1bQ01065 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde1bQ01065 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms