Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb2Q00977 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb2Q00977 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms