Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il6stQ00560 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il6stQ00560 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms