Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HmmrQ00547 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HmmrQ00547 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HmmrQ00547 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms