Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx3P70354 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx3P70354 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx3P70354 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx3P70354 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx3P70354 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx3P70354 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms