Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gfi1P70338 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gfi1P70338 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms