Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac2P70288 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac2P70288 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms