Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp3P70281 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp3P70281 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp3P70281 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms