Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubb4bP68372 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms