Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Barhl1P63157 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Barhl1P63157 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Barhl1P63157 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms