Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabrb3P63080 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabrb3P63080 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms