Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2bP62915 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2bP62915 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2bP62915 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms