Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl23P62830 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl23P62830 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms