Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps4xP62702 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps4xP62702 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms