Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd3P62320 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms